Η πτήση χαμηλού κόστους ήταν προγραμματισμένο να αναχωρήσει στις 16:40. Ωστόσο, ενώ το αεροσκάφος είχε ξεκινήσει τη διαδικασία τροχοδρόμησης, παρουσιάστηκε τεχνικό ζήτημα, με τον πιλότο να αποφασίζει την επιστροφή του στη θέση στάθμευσης.
Τεχνικοί ανέλαβαν να πραγματοποιήσουν τους απαραίτητους ελέγχους, προκειμένου να διαπιστωθεί εάν το Boeing μπορούσε να πραγματοποιήσει με ασφάλεια την πτήση. Περίπου δύο ώρες αργότερα έγινε νέα προσπάθεια εκκίνησης των κινητήρων, όμως, σύμφωνα με τις πληροφορίες, εμφανίστηκε εκ νέου σχετική ένδειξη στα όργανα.
Όπως μετέδωσε η ΕΡΤ Χανίων, οι 183 ταξιδιώτες παρέμειναν για περίπου πέντε ώρες μέσα στο αεροσκάφος, με την πολύωρη αναμονή να προκαλεί δυσφορία και έντονες αντιδράσεις. Σύμφωνα με τις ίδιες πληροφορίες, όταν επιβάτες ζήτησαν νερό, ενημερώθηκαν ότι έπρεπε να το αγοράσουν, γεγονός που προκάλεσε ακόμη μεγαλύτερη δυσαρέσκεια.
Όταν τελικά δόθηκε το «πράσινο φως» για την αναχώρηση και το αεροσκάφος άρχισε και πάλι να τροχοδρομεί, αρκετοί επιβάτες δήλωσαν ότι, έπειτα από όσα είχαν προηγηθεί, δεν επιθυμούσαν πλέον να πραγματοποιήσουν το ταξίδι.
Τελικά, 25 επιβάτες επέλεξαν να αποβιβαστούν από το αεροσκάφος. Κατά την επιβίβασή τους σε λεωφορείο, μία γυναίκα τραυματίστηκε στο πόδι και χρειάστηκε να μεταφερθεί με ασθενοφόρο του ΕΚΑΒ στο νοσοκομείο.
